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吉布提港为邻国埃塞俄比亚的主要出海口，是连接亚、非、欧的重要良港。吉目前已建成6个港口，其中，吉港口股份有限公司（PDSA）管辖4个港口：多哈雷多功能港、老港、塔朱拉港和古拜特盐码头；吉港口与自贸区管理局（DPFZA）管辖油码头；多哈雷集装箱码头管理公司管辖多哈雷集装箱码头。在建港口1个，吉港口与自贸区管理局投资大马角工业区油码头。

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